《数量性状遗传分析》的主要内容由两部分组成。一部分是基于经典遗传学的数量遗传学。首先, 在多基因遗传体系假说下, 讲述了数量性状多基因间的有关加性、显性和上位效应内含的遗传统计学模型; 定义了基因在群体中的平均效应和个体的育种值, 探讨了基因型值和育种值间的关系; 讲述了品系间杂交有关近交群体的伯明翰学派的遗传分析特点, 阐明了远交群体的北美学派的遗传分析方法; 论述了遗传力、重复力和相关的定义、估计方法和假设检验; 讲述了单性状选择及综合选择指数的有关概念、分析和发展; 论述了作者提出的组合性状和组合性状对的遗传分析和应用; 讲解了交配效应和配合力分析。在主基因-多基因遗传体系之下, 简介了它的分离分析的理论和方法, 并探讨它的综合选择指数的分析方法。第二部分是在数量性状的分子遗传学研究上, 简述了QTL定位、分子标记辅助选择和基因组功能分析。在有关多性状选择基因组功能分析中, 利用通径分析及其决策分析给出了各因子的直接作用、间接作用和总作用, 并对各因子在选择和功能上的主次作用进行了判断。