《病理生理学（第3版 供8年制及7年制“5+3”一体化临床医学等专业用）》以继续贯彻教材的思想性、科学性、先进性、启发性和适用性为前提，通过广泛征求用书教师的意见和编委会的认真讨论，进行了如下调整：
①《病理生理学（第3版 供8年制及7年制“5+3”一体化临床医学等专业用）》分三部分，即绪论和疾病概论、疾病的基本病理过程和器官系统功能障碍。其中，“基本病理过程”部分从基因、细胞到复杂体系功能紊乱循序渐进地展现在不同疾病状态下可能同时出现的、成套的并各具特征的病理改变。
②《病理生理学（第3版 供8年制及7年制“5+3”一体化临床医学等专业用）》结合长学制学生基础知识更扎实、自学能力更强、培养目标更高的目标，增加了一些疾病研究的发展史，使相关结论有据可查；增加了发病机制和防治研究的理论和技术进展。
③《病理生理学（第3版 供8年制及7年制“5+3”一体化临床医学等专业用）》注重基础与临床结合，在“基本病理过程”的每一章中均增加了一节，讲述“与相关疾病”的关系，如“酸碱平衡紊乱与相关疾病”等；还在每一章增加了相关病例讨论。
④为完善病理生理学课程体系、减少与其他教材重复，以“糖代谢紊乱”和“脂代谢紊乱”替代“代谢综合征”；增加了“炎症”；删除了“组学与疾病”、“肿瘤”、“胃肠功能障碍”；精简了“细胞信号转导”、“细胞凋亡”、“细胞增殖分化障碍”，合并成“细胞功能紊乱”。
⑤以配套教材增加了“知识拓展”，为学有余力者提供相关研究更深更广的阅读素材。