主角工藤新一原本是一位经常帮助警方破案的17岁高中生侦探，被称为“平成年代的福尔摩斯”、“日本警察的救世主”。某一天和青梅竹马的毛利兰在热带乐园游玩时目击黑衣组织的可疑行动，他因为试图跟踪黑衣组织成员而被偷袭，并被灌下代号为“APTX-4869”的神秘药物。新一虽然幸免于死，但身体就此缩小为小学一年级时的模样，情急之下化名为江户川柯南，在邻居阿笠博士的建议下，寄住在毛利兰的父亲毛利小五郎家中。同时他凭借著过人的推理能力，以及使用阿笠博士为他发明的各种道具，让小五郎成为全球知名的名侦探，并借由平时的案件调查努力找寻有关黑衣组织的线索。

《名侦探柯南》处处都扣人心弦：丰富多彩的人物，激荡热烈的情感，诡异绝伦的案件手法，缜密细腻的推理过程，大胆奇妙的思路创新……

本套装包含：

名侦探柯南 卷49
1 追踪目标！
2 新的指令
3 黑衣组织VS.FBI①
4 黑衣组织VS.FBI②
5 新老师
6 秘密的上学路①
7 秘密的上学路②
8 回不去的两人
9 被密封的车
10 虚假的爱情
番外 ☆特别附录☆ 名侦探柯南完全人物手册

名侦探柯南 卷50
1 紧迫的联谊会
2 秘密的家访
3 无聊的比赛
4 中头奖！
5 令人兴奋的采访
6 真正犯人的留言
7 THE・少年侦探团
8 平次的回忆
9 雷女之计
10 谜一样的缆车
11 银衣雪女传说

名侦探柯南 卷51
1 风雪中的复仇
2 钓鱼事件
3 三条鱼
4 令人叹息的赶海
5 饮料瓶之怪
6 混合的诡计
7 俄罗斯蓝猫
8 此“五郎”非彼“五郎”
9 打不开的窗
10 制造密室
11 魔鬼的出入口

名侦探柯南 卷52
1 形迹可疑？！
2 命中注定的试映会
3 婚礼现场的恐慌
4 不速之客
5 婚礼上的战争
6 违背常理的房间
7 神秘的颠倒
8 想隐藏的东西
9 园子的红手帕
10 罗马字的名字
11 超人

名侦探柯南 卷53
1 红莲
2 金色
3 青岚
4 纯白
5 怪人二百面相
6 1年级B班大作战
7 目击者仅一人
8 钉子和蛇
9 锤子的真相
10 不可思议的打工
番外・特别附录・The Movie 1～10完全故事导读

名侦探柯南 卷54
1 晚餐的菜单
2 做梦的星星
3 侦探团的雪人
4 坠落的轨迹
5 雪山上的悲惨结局
6 吃人的房间
7 虚幻的尸体
8 利用血迹的诡计
9 东部的高中生侦探
10 侦探甲子园
11 密室证明

名侦探柯南 卷55
1 侦探们的名推理
2 热血侦探
3 元太的射门
4 元太和L
5 淘气鬼
6 月下
7 黎明
8 白昼
9 落日
10 神神秘秘的妃英理①
11 神神秘秘的妃英理②

名侦探柯南 卷56
1 订婚戒指？！①
2 订婚戒指？！②
3 订婚戒指？！③
4 鬼婆传说杀人事件①
5 鬼婆传说杀人事件②
6 鬼婆传说杀人事件③
7 来自西方的线索
8 照片的去向
9 公司
10 打错的电话？！
11 血型叙述的真相