基于化学小分子探针的信号转导过程研究”重大研究计划是国家自然科学基金委员会从推动和促进我国科学技术跨越式发展的战略高度出发，于2007年启动的个面向化学生物学领域的重大研究计划。经过严格的同行评议筛选，共有来自全国19个省、自治区、直辖市的160个项目获得了资助，涉及数学物理、化学、生命、工程与材料、信息和医学等六个学部。通过全体项目科学家的不懈努力，该重大研究计划以小分子探针为主要工具，对细胞信号转导中的重要分子事件和机理进行了深入的研究，尤其是在细胞命运调控、糖脂代谢、多能性维持与重编程及一系列经典信号转导通路的研究中取得了突破性进展。揭示了细胞增殖、分化、凋亡、迁移及重编程等生命过程的分子机制，解析了其与细胞信号转导通路和表观遗传调控的关系，并获得了特异干预和调控相应过程的靶向分子，实现了既定科学目标，于2015年圆满结束，并在国家自然科学基金委员会组织的结题验收中被评为很好。