本书分正编与附翼。正编又分为上部与下部。上部是《经方用药法律与单方治验》，以论药为主。其主要内容有三：，探索经方用药之本源，故列《本经》《别录》于前，并精选历代本草学家的相关解析。第二，探索经方用药之法律，故列“经方运用”于中，此为上部的“重头戏”，力求深入探索仲景用药心法，总结其规律，使读者学有心得，用有规范。第三，选录古今医家应用单方治病之丰富经验，列于每药之后，以唤起人们对单方治病的重视。下部是《经方诠释类解与验案精选》，以论方为主。再版之“验案精选”大多数是重新选录的，目的是避免与《伤寒杂病论研究大成》之“验案精选”之案例重复。读者可将两书的“验案精选”综合读之，更能开拓用好经方的思路。“编者按”是吕教授对所选验案之大多数经缜密思考而加的。“经方类解”是串解该类经方之间药物加减、剂量变更、功效与主治等诸多方面的变化规律。这是本书的独立创作。如上经方诠释、验案精选、编者按语、经方类解等四个方面混为一体，切实而有创意。编者苦心，读者识之。附翼《仲景医学纵横研究选粹》之内容有两大部分：一是版的学术顾问（刘渡舟、李培生、夏锦堂、李恩）、主审（王云凯、许占民、张家礼、赵玉庸、郭忠印）、总主编（吕志杰）及上编与下编主编（吴凤全、王彦田、傅延龄）等13人的论文再次选录一部分，他们中有的论文是新撰写的。二是再版新邀请的学术顾问（三位国医大师：朱良春、路志正、李今庸）、副主编、主参审、编委等几十人的论文与医案择优选录。