全书共分为五个部分，包含930幅图片，每个部分均采用不同的颜色标识，便于读者学习和查询：
第一部分，阐述了本图谱的使用方法以及颅脑断层影像的基础知识及其解剖标志。第二部分，展示了颅脑冠状位、矢状位、横断面切面图和脑干序列切面图。第三部分，展示了头颈部不同轴位切面的解剖结构，包括颅骨、颅腔及其内含结构，面部解剖，以及颅颈交界区的解剖，不仅包含各切面内的组织结构，还包含血管、神经。第四部分，描述了神经功能系统和神经活性物质，具体包括：
感觉系统、味觉系统、前庭系统、听觉系统、上行网状系统、运动系统、小脑系统、语言系统
、边缘系统、自主神经系统等神经功能系统在大脑切面中的走形、分布、功能和临床意义。
神经活性物质如儿茶酚胺能神经元、血清素能神经元、组胺能神经元、胆碱能神经元等的分布、作用机制和功能。第五部分介绍了本书切面图片的来源、技术和参考书目，并附文后索引，方便读者查阅需要的条目。