《疫苗手册：临床医生实用指南（第4版，W）》分为疫苗学基本原理和免疫接种实施、疾病与疫苗、附录三个部分。在疫苗学基本原理和免疫接种实施部分，分为疫苗学导论，美国疫苗管理的基本框架，标准、原则和规章，免疫接种实施，一般建议，特殊情况下的免疫接种，解除对疫苗的担忧，免疫程序8个章节；在疾病与疫苗部分，根据疾病及其相应的疫苗分为20个章节（其中百日咳、白喉和破伤风作为一个章节，麻疹、流行性腮腺炎和风疹作为一个章节），加上联合疫苗一个章节，共21个章节；每个章节又分为病原体、临床特征、流行病学和传播、免疫规划、疫苗、效力和（或）免疫原性、安全性、建议等八个部分；在疾病与疫苗部分的每个章节有一张简要说明疫苗特性的表。此外，在每个章节末尾，有详尽的参考文献可供进一步阅读。附录包括政府机构、国际机构、专业协会和学会，倡导、实施和安全，覆盖率和评估等组织的名称及其网址；书籍；生产商和供应商的名称及其网址；州卫生部门免疫规划处的网址；缩写词；疫苗和传染性病原体名称等，可供进一步查阅。